建cDNA文库时,首先需分离细胞的核酸部分是( )
A.染色体DNA
B.线粒体DNA
C.总mRNA
D.tRNA
E.rRNA
A.染色体DNA
B.线粒体DNA
C.总mRNA
D.tRNA
E.rRNA
第2题
选择出不含LexA-Ras质粒,仅含VP16-cDNA质粒的“痊愈”细胞,这些细胞可用在缺乏组氨酸的平板上检查是否生长和在有XGAL存在时的显色情况而被挑选出来。那些不能在组氨酸平板上生长和有XGAL存在时形成白色菌落的“痊愈”细胞用LexA-核纤层蛋白质粒转化,并再次在上述平板上测试生长,只有那些在缺乏His的平板上不生长且形成白色菌落(含XGAL)的含LexA-核纤溶蛋白基因质粒的细胞可用于进一步分析。
在1.4×106个原始转化体中仅有19个菌落满足详细分析的严格标准。再测定每种细胞中插入到VP16基因片段的下游的cDNA序列时,将发现:9个菌落(克隆)均有插入的cDNA,均与Raf丝氨酸/苏氨酸激酶的N末端相对应,6个与C-Raf对应,3个与A-Raf对应。
这是一个令人兴奋的发现,因为其他的工作仅能显示Raf的免疫沉淀物可使MAP-激酶磷酸化而激活,如果Raf真能与Ras结合,我们就能找到GTPase单体与MAP-激酶之间的级联中所缺少的一环。
为了验证上述发现所暗示的相互作用是否正确,可构建一些含融合蛋白基因的质粒,如麦芽糖结合蛋白与Raf间的融合蛋白(MBP-Raf)、谷光甘肽-S-转移酶和Ras的融合蛋白(GST-Ras),之后让这两种融合蛋白质粒在细菌中扩增,在直链淀粉亲和柱上通过它们的混合物检验他们结合的能力,而直链淀粉亲和柱可与MBP-Raf结合。用麦芽糖洗脱被束缚的蛋白质,这时会发现一条明显的GST-Ras蛋白随着MBP-Raf蛋白一起洗脱的曲线。这个结论为双杂交系统的遗传学结论提供了生化证据。
第4题
当处理过的细胞分化时,大约25%的细胞转变为肌肉细胞(肌原纤维),肌原细胞形成的高频率导致一种假说的建立,一个独立的主调控基因,它正常情况下由于甲基化受到抑制,它可以启动完整的转化。估计这个基因在用5'-氮化胞苷处理前是处于关闭状态,而在诱导的肌原细胞中呈开放状态。如果这个设想是真的,在用5'-氮化胞苷处理后的mRNA的cDNA拷贝中应能找到与这个用5'-AzaC处理后就开始启动的基因有关的序列。对策是应用一套放射性探针从正常肌原细胞(这种细胞按照你的设想也能表达这个基因)获得的cDNA文库中挑选可能的cDNA克隆。应准备三种放射性探针:
探针1:从5'-氮化胞苷诱导的肌原细胞中分离RNA,制备含放射性的cDNA探针。
探针2:用5'-AzaC处理的肌原细胞中的有放射性的cDNA与未经处理的10T1/2细胞中的RNA进行杂交,除去所有的RNA和DNA杂合体。
探针3:从正常的肌原细胞中分离RNA,制备放射性DNA探针,然后与未经处理的10T1/2细胞中的RNA杂交,除去所有的RNA和DNA杂合体。
第一个探针同cDNA文库中的大多数克隆发生了杂交,但是这些克隆中只有约1%的克隆与探针2或探针3进行杂交。总之,有四种独特的杂交模式(表13-3-54)。
表13-3-54 | |||
Class | Probe 1 | Probe 2 | Probe 3 |
A B C D | + + + + | — — + + | — + — + |
第8题
A.敏感性高
B.能真实反应细胞内蛋白质间相互作用情况
C.使蛋白质表现型和基因型相联系
D.不需分离靶蛋白
E.可以筛选cDNA文库
第11题
你在一种高效的克隆载体λYES(酵母一大肠杆菌中穿梭)中构建了一个cDNA文库,这种载体是由细菌噬菌体λ基因和一种可在大肠杆菌和酵母中复制的质粒重组而成,它结合了病毒和质粒克隆载体的优点。cDNA可以插入到载体的质粒部分,这样就可以在体外被包装进一个病毒衣壳,包装后的载体感染E.coli比质粒自身更有效,一旦进入E.coli,在λYES中的质粒序列可诱导脱离λ基因组进行重组并可自我复制,这就使cDNA在质粒上与λ分离,这就有利于以后的操作。
为了使克隆效率最大,载体和cDNA均用特殊的方法加以制备,在载体DNA单一独特的XhoI位点切割(5'-CTCGAG)后在dTTP存在下与DNA多聚酶一起孵育,一个制备好的钝端cDNA与一个双链寡核苷酸接头连接,这个接头由两个寡核苷酸5'-CGAGATTTACC和5'-GGTAAATC组成,其5'-末端均有磷酸基团,然后DNA和cDNA混匀并进行连接。这个方案证实非常有效,用2μg载体和0.1mg cDNA,你可以得到4×107重组分子组成的文库。