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[主观题]

通过差示杂交后制备的cDNA文库使克隆那些只在特定分化细胞中表达基因的概率大为提高。

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第1题

先进行差示杂交,杂交后再制备cDNA文库,以提高特定条件下表达基因的概率。 ()此题为判断题(对,错)。
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第2题

小鼠胚胎细胞成纤维细胞细胞系10T1/2是一个非常稳定的细胞系,它的细胞以及细胞的行为看起来都与正常成纤维
细胞相似。如果这些细胞在含5'-氮化胞苷的培养基中培养24小时,随后当它们长到很高的密度时,用5'-Azac处理会降低DNA甲基化的正常水平,使原先没有活性的基因活化为开放基因。它们将分化为软骨细胞、肥大细胞和肌肉细胞。如果这些细胞用5'-AzaC处理过后,在低细胞浓度下生长,它们保持原有成纤维细胞的特性,但是当生长许多代后,细胞达到高密度时又会分化。10T1/2细胞如果不曾用5'-氮化胞苷处理过,无论细胞浓度如何都不会引起分化。

当处理过的细胞分化时,大约25%的细胞转变为肌肉细胞(肌原纤维),肌原细胞形成的高频率导致一种假说的建立,一个独立的主调控基因,它正常情况下由于甲基化受到抑制,它可以启动完整的转化。估计这个基因在用5'-氮化胞苷处理前是处于关闭状态,而在诱导的肌原细胞中呈开放状态。如果这个设想是真的,在用5'-氮化胞苷处理后的mRNA的cDNA拷贝中应能找到与这个用5'-AzaC处理后就开始启动的基因有关的序列。对策是应用一套放射性探针从正常肌原细胞(这种细胞按照你的设想也能表达这个基因)获得的cDNA文库中挑选可能的cDNA克隆。应准备三种放射性探针:

探针1:从5'-氮化胞苷诱导的肌原细胞中分离RNA,制备含放射性的cDNA探针。

探针2:用5'-AzaC处理的肌原细胞中的有放射性的cDNA与未经处理的10T1/2细胞中的RNA进行杂交,除去所有的RNA和DNA杂合体。

探针3:从正常的肌原细胞中分离RNA,制备放射性DNA探针,然后与未经处理的10T1/2细胞中的RNA杂交,除去所有的RNA和DNA杂合体。

第一个探针同cDNA文库中的大多数克隆发生了杂交,但是这些克隆中只有约1%的克隆与探针2或探针3进行杂交。总之,有四种独特的杂交模式(表13-3-54)。

表13-3-54

ClassProbe 1Probe 2Probe 3
A

B

C

D

+

+

+

+

+

+

+

+

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第3题

在cDNA文库中,分离到两个不同的cDNA克隆,都可以与神经生长因子探针杂交。两个克隆开始区和终止区
序列相同,中间的序列不同。如何解释这个结果?

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第4题

从cDNA文库中随机检出成千上万的克隆,单边测序后产生的cDNA标记称为_________。

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第5题

候选克隆法克隆基因的步骤有()

A.通过DNA连锁分析确定待分离基因在染色体上的大概位置

B.进行分子杂交,定位基因在染色体上的具体位置

C.研究该区域内的已知基因、ORF、EST或cDNA片段,确定进一步研究对象

D.通过cDNA筛选、外显子捕获或物理捕获法在该区域内寻找和鉴定基因

E.对找到的“基因”的核苷酸序列进行分析,推测其功能

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第6题

_________是制备高质量cDNA文库的前提。

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第7题

EST是______,是通过从cDNA文库中随机挑选克隆,进行一轮单向测序所获得的序列,通常为几十到500bp左右,他们大
多不是完整的基因序列,但携带了表达基因的部分遗传序列。
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第8题

从正常细胞和反转录病毒(不含癌基因)感染的细胞(克隆1)中,分别分离出DNA,用限制酶酶切后做电泳并

从正常细胞和反转录病毒(不含癌基因)感染的细胞(克隆1)中,分别分离出DNA,用限制酶酶切后做电泳并转膜。以某原癌基因的cDNA作探针进行杂交,结果如下图所示:

反转录病毒插入位置在哪里?

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第9题

人类基因组DNA经过Sau3A(G↓ATC)部分酶切后,连接到载体pCU999的BamHⅠ位点上 (G↓GATCC)。BamHⅠ位于

人类基因组DNA经过Sau3A(G↓ATC)部分酶切后,连接到载体pCU999的BamHⅠ位点上 (G↓GATCC)。BamHⅠ位于多克隆位点的SalⅠ和NotⅠ之间,二者距离20 bp。 (1)从文库中分离出某克隆(克隆1),分别用NotⅠ(N)、SalⅠ(S)或SalⅠ十NotⅠ(S十N)酶切后,电泳分离并用EB染色。DNA转移到膜上后,用载体上的DNA作为探针进行杂交,结果如下图所示:

假设同源序列50 bp以下则无杂交信号。在此基因组DNA上标上所有的SalⅠ和NotⅠ位点,标明酶切位点间距离。 (2)从同样的文库中分离到带有重叠片段的克隆(克隆2),用同样的酶切、电泳、转膜后,以克隆1的DNA为探针(包括基因组DNA和载体DNA)进行southern杂交,结果如下图所示:

画出克隆2的图,标明所有SalⅠ和NotⅠ位点及位点间距离。 (3)所有的人类基因组DNA都用SalⅠ酶切,并用来自于克隆1或克隆2的DNA为探针作Southern杂交,结果如下图所示:

其中6个SalⅠ切点的位置可以用以上的结果来确定。请画出这一区域的SalⅠ位点图。

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第10题

在构建cDNA克隆之前,可以用______来富集一特殊的核苷酸序列。做法是:用来自于能够产生目的蛋白的细胞mRNA分
子同来自于另一类型细胞(不产生这种蛋白质,但亲缘关系密切)的过量mRNA分子杂交。
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第11题

用cDNA差示分析法进行分析时,实验材料和探针材料之间的摩尔比为________。

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