第1题
为了形成稳定突变,需从重组克隆宿主(E.coli)中构建Pseudomonas aeruginosa的基因文库,并把该基因文库中克隆的突变基因转入一野生型组织。用已知的接合和质粒不相容性知识设计一方案。
第2题
你在一种高效的克隆载体λYES(酵母一大肠杆菌中穿梭)中构建了一个cDNA文库,这种载体是由细菌噬菌体λ基因和一种可在大肠杆菌和酵母中复制的质粒重组而成,它结合了病毒和质粒克隆载体的优点。cDNA可以插入到载体的质粒部分,这样就可以在体外被包装进一个病毒衣壳,包装后的载体感染E.coli比质粒自身更有效,一旦进入E.coli,在λYES中的质粒序列可诱导脱离λ基因组进行重组并可自我复制,这就使cDNA在质粒上与λ分离,这就有利于以后的操作。
为了使克隆效率最大,载体和cDNA均用特殊的方法加以制备,在载体DNA单一独特的XhoI位点切割(5'-CTCGAG)后在dTTP存在下与DNA多聚酶一起孵育,一个制备好的钝端cDNA与一个双链寡核苷酸接头连接,这个接头由两个寡核苷酸5'-CGAGATTTACC和5'-GGTAAATC组成,其5'-末端均有磷酸基团,然后DNA和cDNA混匀并进行连接。这个方案证实非常有效,用2μg载体和0.1mg cDNA,你可以得到4×107重组分子组成的文库。
第3题
第4题
(1)画出该质粒的酶切图谱,标明抗性基因的位置和酶切位点。 (2)如用HindⅢ切割未标记的上述DNA片段,得到5.5 kb和2.5 kb两段。如果在EcoRⅠ的3.5 kb酶切片段上没有HindⅢ切点,则用双酶(EcoRⅠ+HindⅢ)切割后会得到什么样的片段?
第5题
有人建议用PCR扩增同该蛋白质结合的微量DNA,思路是(图Q25.8):①合成一组长为26个碱基的随机序列的寡聚核苷酸混合体,在该序列的两侧各有一段25个碱基的序列作为PCR扩增的引物位点[图Q25.8(a)];②把这些寡聚核苷酸加到含有转录因子的细胞粗提取物中,转录因子可以同含有结合位点的寡聚核苷酸结合;③用转录因子特异的抗体分离同转录因子结合的寡聚核苷酸;④用PCR扩增选择到的寡聚核苷酸进行序列分析。
图Q25.8 用随机的寡聚核苷酸选择和扩增特异的DNA序列(a)用于选择的原初随机序列的寡聚核苷酸,N代表任何一种核苷酸;EcoR Ⅰ和BamH Ⅰ位点有利于选择DNA的克隆和序列分析。(b)同序列特异的DNA结合蛋白结合的寡聚核苷酸的选择和序列分析方案按照这一思路,用0.2ng单链随机序列的寡聚核苷酸开始了这项实验,这个寡聚核苷酸可以同一个PCR引物结合成部分双链,经过如图Q25.8(b)所示的四轮选择和复制后,用BamH Ⅰ和EcoR Ⅰ消化分离到的DNA,将片段克隆到质粒中,并测定了10个独立的克隆(表Q25.1),问:
表Q25.1 10个克隆的序列
注:画线的序列是PCR引物部位,两种序列都是从BamH Ⅰ末端开始,所有序列中结合位点的方向都是相同的。
第7题
为了检验克隆受体的信号转导过程和分析它们的适应特征,可将含受体的细菌接受天冬氨酸浓度突然变化这一刺激。在缺乏引诱物的情况下,野生型菌株每隔几秒钟改变一次转动(摆动)方向。一旦加入引诱物,转动方向改变这一活动被抑制,因而引起一段时期的平衡活动。若引诱物浓度保持恒定(即使浓度很高),野生型菌株很快适应,再次开始每隔几秒钟一次的摆动。为观察在实验条件下这些行为的改变,你可粘连细菌的鞭毛到盖玻片上,以便观察它们转动的方向。加入天冬氨酸并计算在加入天冬氨酸后1分钟未改变转动方向的细菌的数目。野生型细胞和含克隆天冬氨酸受体的细胞的结果如图14-3-27。
第8题
第9题
质粒pBR607DNA是双链环状的,分子量为2×106U。这个质粒带有两个基因,它们所编码的蛋白质产物使宿主细菌对四环素和氨苄青霉素具有抗性(Tet-r和Amp-r)。该DNA对下列限制酶只有一个识别部位:EcoRI、BamHI、HindⅢ、PstI和SaII。将DNA克隆到EcoRI部位并不影响对两种药物的抗性。将DNA克隆到BamHI、HindⅢ和SaII部位则破坏四环素抗性。克隆到PstI部位破坏氨苄青霉素抗性。用下列限制酶混合物消化可得到如表16-2-10所列的片段。试在限制酶图上标出相对于EcoRI切点的PstI、BamHl、HindⅢ和SalI的切点。
表16-2-10 | |
酶混合物 | 片段分子量(×106U) |
EcoRI,PstI EcoRl,BamHI EcoRI,HindⅢ EcoRI,SalI EcoRI,BamHI,PstI | 0.64.2.14 0.2.2.4 0.05.2.55 0.55.2.05 0.2.0.64.1.94 |
第10题
假定有一细菌的某种基因含1000个碱基对。用一种诱变剂处理细菌培养物,该基因中的突变以每105个细胞一个突变体的频率回复。取其中的一个突变体,进行培养,并得到这一突变体的纯培养物。然后用同一诱变剂处理,并在每5~10个细胞中找到一个回复子。从回复子中获得的基因产物是否会具有同野生型细胞一样的氨基酸顺序?试作解释。
第11题