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[主观题]

你测序了酵母的一段DNA,并推测含有一个野生型的基因。作为研究策略,你需要获得该基因的突变表型,你如何用克

隆得到的野生型的基因去获得突变型?
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更多“你测序了酵母的一段DNA,并推测含有一个野生型的基因。作为研究策略,你需要获得该基因的突变表型,你如何用克”相关的问题

第1题

假定你从黏质沙雷氏菌中克隆了一个基因,并推测可能是依赖于锌的金属蛋白酶,因为它含有两个组氨酸和一个谷氨
酸与锌形成锌指结构。请你设计一个方案,改变其中一个组氨酸看看是否改变蛋白酶的活性?
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第2题

一个癌基因,从序列上看似乎编码一个转录因子。当放在细胞中表达时,该基因的产物是完全不溶的,这影响了对其功
能的直接检测。免疫染色表明,这种蛋白质定位于细胞核内,如同推测的一样,是一种转录因子。如果能够测出它所结合的DNA序列,就可以从现有的序列资料中查找已知基因启动子的天然位点,从而能够找到它所调节的基因。

有人建议用PCR扩增同该蛋白质结合的微量DNA,思路是(图Q25.8):①合成一组长为26个碱基的随机序列的寡聚核苷酸混合体,在该序列的两侧各有一段25个碱基的序列作为PCR扩增的引物位点[图Q25.8(a)];②把这些寡聚核苷酸加到含有转录因子的细胞粗提取物中,转录因子可以同含有结合位点的寡聚核苷酸结合;③用转录因子特异的抗体分离同转录因子结合的寡聚核苷酸;④用PCR扩增选择到的寡聚核苷酸进行序列分析。

图Q25.8 用随机的寡聚核苷酸选择和扩增特异的DNA序列(a)用于选择的原初随机序列的寡聚核苷酸,N代表任何一种核苷酸;EcoR Ⅰ和BamH Ⅰ位点有利于选择DNA的克隆和序列分析。(b)同序列特异的DNA结合蛋白结合的寡聚核苷酸的选择和序列分析方案按照这一思路,用0.2ng单链随机序列的寡聚核苷酸开始了这项实验,这个寡聚核苷酸可以同一个PCR引物结合成部分双链,经过如图Q25.8(b)所示的四轮选择和复制后,用BamH Ⅰ和EcoR Ⅰ消化分离到的DNA,将片段克隆到质粒中,并测定了10个独立的克隆(表Q25.1),问:

表Q25.1 10个克隆的序列

注:画线的序列是PCR引物部位,两种序列都是从BamH Ⅰ末端开始,所有序列中结合位点的方向都是相同的。

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第3题

酵母的Ty1元件是一种_________,它的转座需一段完整RNA转录物的合成,这个转录物又被复制成一个双
螺旋DNA,随后被整合到一个新的染色体位置。

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第4题

当两个DNA的突变片段相互间不能反式互补,则可以推测这两个突变影响了同一种功能。这样的两个突变和每个不能
反式互补的突变分为同一个互补群,并被认为是一个独立遗传单位的一部分。这个遗传单位可能是一个顺反子,或者如果突变稳定地干扰了转录过程,这可能是一个多顺反子转录单位。
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第5题

一段很清楚的双脱氧测序胶样品如图16-3-26所示,试着阅读一下,依次从胶的顶的方向阅读,这个序列对应的mRNA可

一段很清楚的双脱氧测序胶样品如图16-3-26所示,试着阅读一下,依次从胶的顶的方向阅读,这个序列对应的mRNA可能翻译成一个蛋白质,你能找出这个序列的开放阅读框吗?

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第6题

由酵母交配型基因座产生的关键调控蛋白之一是一个抑制蛋白,称做α2。在可交配型的单倍体细胞中,α2对于关闭一

由酵母交配型基因座产生的关键调控蛋白之一是一个抑制蛋白,称做α2。在可交配型的单倍体细胞中,α2对于关闭一系列涉及到交配型特异性的基因是必需的。在α2二倍体细胞中,α2抑制物同α1基因产物协同作用,关闭了除α特异性基因外的一系列单倍体特异性的基因。两类有区别又相互关联的保守DNA序列在这两套控制基因的上游被发现,一个在单倍体特异性基因前,另一个在α特异性基因前。根据这些上游序列的相关性,很有可能α2与两者都结合。然而,它的结合特性在它能识别单倍体特异性基因前必须通过α1蛋白以某种方式进行修饰。至此,这种修饰作用的本质是什么?α1是能催化α2的共价修饰,还是能与α2结合而修饰α2蛋白?

为了认清这些问题,要做三个实验。首先,在单独作用和共同作用两种方式下,测定α1和α2与两种上游调控DNA位点的结合(图13-3-50所示)。α1单独不能同含有任何调控位点的DNA片段结合。然而α2虽能与α专一性片段结合,但是不能同单倍体专一性片段结合。α1和α2的混合物同两者都能结合。

在第二个实验中,大量的含α专一性序列的未标记DNA加入到α1和α2蛋白的混合物中。在这样的条件下,单倍体专一性片段仍被束缚。同样,如果加入过量的含有单倍体专一性片段的未标记DNA到混合物中,α专一性片段仍然被束缚。

在第三个实验中,改变不同的α1和α2的比例,当α2过量时,同单倍体专一性片段的结合减弱,而当α1过量时,同α专一性片段的结合减弱。

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第7题

请你提供两份计划:第一份要确证只有单一序列DNA被测序,第二份应该保证只有被测序的单一序列DNA是可转录的。
简要描述你的这两份计划。
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第8题

假如你想在体外研究一个含有几个基因和几个启动子的DNA上某一基因的转录。你如何在不填加特定的调节蛋白的情
况下,刺激你的目的基因的转录,而不影响其它基因的转录。
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第9题

你纯化出经BamHI消化重组质粒DNA所得的两个DNA片段,其中一个长为400bp,另一个长900bp,你想要如图16-3-20(1)

你纯化出经BamHI消化重组质粒DNA所得的两个DNA片段,其中一个长为400bp,另一个长900bp,你想要如图16-3-20(1)所示将它们连接起来产生一个杂合基因,如果你的推测是正确的话,就会得到令人惊奇的新物质。

你在DNA连接酶存在情况下将两种片段混合在一起并且进行孵育,30分钟后和8小时后,你取一些样品进行琼脂糖凝胶电泳分析,你惊讶地发现连接得到了一系列复杂的DNA片段而不是所需的1.3kb小片段,并且发现孵育时间越长,小片段浓度越低而大片段浓度增加,如果你用BamHI切割连接后的重组体,你会重新获得开始的两片段(图16-3-20(2)A)。

令人吃惊的是,你将从琼脂糖凝胶中纯化得到的1.3kb片段用BamHI消化,检查它的结构,与预想的一样,可以得到最初的两片段(图16-3-20(2)B)。这就可以确定这是你所需的结构。但是,你用EcoRl消化另一份样品,你希望通过消化得到300bp的片段和700bp的片段,但你跑的电泳是一系列DNA片段(图16-3-20(2)B)。

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第10题

在SGD数据库中鉴定了一个酵母蛋白质,它来自开放阅读框YDR477W。下面哪一个是你下一步能够找到有关这个蛋白质更多信息的最好的地方( )

A.MIPS

B.COG

C.GenBank

D.expasy

E.KEGG

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第11题

酵母细胞的一个突变株被发现它的GAL4蛋白其N端缺失了70个氨基酸序列,蛋白质其它的部分是正常的。你认为这种
突变株对半乳糖代谢酶的诱导有什么改变?
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