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[主观题]

简述转录因子结合位点识别的操作流程。

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第1题

亮氨酸拉链蛋白所识别的DNA有何特点?如何理解亮氨酸拉链转录因子的二聚体结构同识别位点的关系?
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第2题

每个转录因子结合位点仅被一个转录因子识别
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第3题

下列哪些条件能翻译?为什么基因在它们的转录因子存在时不是总有活性?

A.转录因子结合位点的前后关系。

B.替换蛋白的存在。

C.转录因子结合位点的染色质结构。

D.不存在协同作用蛋白质。

E.上述都是。

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第4题

为什么一些基因在它们的转录因子存在时并不总是处于活性状态?下列解释正确的是()。A.转录因子

为什么一些基因在它们的转录因子存在时并不总是处于活性状态?下列解释正确的是()。

A.转录因子结合位点的邻近序列

B.有其他蛋白的结合

C.转录因子结合位点的染色质结构状态

D.缺少共激活蛋白

E.以上都是

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第5题

真核生物的TATA框是()

A.DNA合成的起始位点

B.能够与转录因子TFII结合

C.RNA聚合酶的活性中心

D.翻译起始点

E.转录起始点

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第6题

组蛋白H2A基因在所有细胞中都进行表达,而免疫球蛋白基因只在淋巴样细胞中表达。两类基因的启动子都含有转录
因子Oct-1的结合位点,Oct-1也存在于这两类细胞中,但为什么免疫球蛋白只在淋巴样细胞中表达?
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第7题

你已经建立了一个体外转录系统。使用一个已知的DNA片段,它可在一个病毒启动子的控制下被转录。当在系统中加入
纯化的RNApolⅡ、TFⅡD(TATA结合因子)和TFⅡB、TFⅡE(与RNA聚合酶结合)后,DNA开始被转录。然而,体外转录系统的低效率暗示可能有一个额外的调控序列与转录因子结合,而这种转录因子在纯化的组合当中并不存在,为了寻找与这个被推测的调控因子结合的DNA序列。你做了一系列在转录起始点上游的缺失(如图13-3-44B所示),比较它们在纯化系统中及在细胞粗提物中的转录活性。作为内部控制,你将每种缺失体与一个能产生生长转录本的未缺失的模板混合(如图13-3-44A)。这些分析的结果(图13-3-44C)显示,一直缺失到-61,对转录仍无影响,而-11的缺失在两种系统中都会使转录受到抑制。使人惊奇的是一50位的缺失体可以像未损失的模板一样在纯化系统内进行有效的转录。但是在细胞粗提物中却没有这种作用。

你纯化了与这种效应有关的蛋白,显示它使非缺失的模板及-61缺失的模板转录都增强了10倍,面对-50缺失的模板无激活作用,印迹分析表明这个因子同一个TATA位点上游的特殊的短序列相结合,虽然这种因子在TFⅡD缺乏时同它的结合位点的结合是短暂的,但当TFⅡD存在时,它可与结合位点稳定地结合。

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第8题

组蛋白基因H2A在所有细胞中表达,但是免疫球蛋白基因仅在淋巴细胞中表达。两个基因的启动子都包含了转录因子O

组蛋白基因H2A在所有细胞中表达,但是免疫球蛋白基因仅在淋巴细胞中表达。两个基因的启动子都包含了转录因子Oct-1的结合位点(在两种细胞中均有Oct-1)。那么为什么免疫球蛋白仅表达在淋巴细胞中?

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第9题

组蛋白H2A基因在所有的细胞中都进行表达,而免疫球蛋白基因只在淋巴细胞中表达。两类基因的启动子
都含有转录因子Oct-1的结合位点,Oct-1也存在于这两类细胞中,但为什么免疫球蛋白只在淋巴细胞中表达?

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第10题

一个癌基因,从序列上看似乎编码一个转录因子。当放在细胞中表达时,该基因的产物是完全不溶的,这影响了对其功
能的直接检测。免疫染色表明,这种蛋白质定位于细胞核内,如同推测的一样,是一种转录因子。如果能够测出它所结合的DNA序列,就可以从现有的序列资料中查找已知基因启动子的天然位点,从而能够找到它所调节的基因。

有人建议用PCR扩增同该蛋白质结合的微量DNA,思路是(图Q25.8):①合成一组长为26个碱基的随机序列的寡聚核苷酸混合体,在该序列的两侧各有一段25个碱基的序列作为PCR扩增的引物位点[图Q25.8(a)];②把这些寡聚核苷酸加到含有转录因子的细胞粗提取物中,转录因子可以同含有结合位点的寡聚核苷酸结合;③用转录因子特异的抗体分离同转录因子结合的寡聚核苷酸;④用PCR扩增选择到的寡聚核苷酸进行序列分析。

图Q25.8 用随机的寡聚核苷酸选择和扩增特异的DNA序列(a)用于选择的原初随机序列的寡聚核苷酸,N代表任何一种核苷酸;EcoR Ⅰ和BamH Ⅰ位点有利于选择DNA的克隆和序列分析。(b)同序列特异的DNA结合蛋白结合的寡聚核苷酸的选择和序列分析方案按照这一思路,用0.2ng单链随机序列的寡聚核苷酸开始了这项实验,这个寡聚核苷酸可以同一个PCR引物结合成部分双链,经过如图Q25.8(b)所示的四轮选择和复制后,用BamH Ⅰ和EcoR Ⅰ消化分离到的DNA,将片段克隆到质粒中,并测定了10个独立的克隆(表Q25.1),问:

表Q25.1 10个克隆的序列

注:画线的序列是PCR引物部位,两种序列都是从BamH Ⅰ末端开始,所有序列中结合位点的方向都是相同的。

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第11题

转录因子SP1结合GGGcGG序列。下图所示为SV40早期启动子中含有的六个这样的“GC”盒。限制酶NdeI和SmaI的切割位
点已显示出。若已有了DNA片段和纯化的SPl,试叙述用DNaseI将SPl结合位点定位在SV40早期启动子上的详细步骤,注意要讲述原材料是如何被标记的以及各种必需的对照。画一个凝胶图显示你的结果(标记每个泳道)。如何利用这些信息、推出哪些位点与SPl有最高的亲和性?

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